Pogrzeb odbył się w sobotę 3 listopada 1984 r. w kościele św. Stanisława Kostki na warszawskim Żoliborzu, macierzystej parafii księdza Jerzego Popiełuszki. Szacuje się, że zgromadził od ok. 600 tys. do miliona osób.
Msza pogrzebowa rozpoczęła się o godzinie 11.00. Koncelebrowało ją dwunastu kapłanów pod przewodnictwem prymasa Polski kardynała Józefa Glempa.
Po ewangelii przypomniano biogram księdza Popiełuszki, odczytano fragmenty jego kazań, przemawiali przedstawiciele różnych zebranych środowisk. Mimo obaw władz o zamieszki i demonstracje uroczystości przebiegły spokojnie. Grób kapłana przy kościele św. Stanisława Kostki stał się miejscem pamięci i celem pielgrzymek.
Pogrzeb księdza Popiełuszki był czymś więcej niż pożegnaniem zamordowanego kapłana. Stał się manifestacją sprzeciwu wobec przemocy komunistycznych władz oraz wyrazem solidarności społeczeństwa. Przypominał również o przesłaniu księdza Jerzego, który wzywał, by „zło dobrem zwyciężać”. W 2010 r. został beatyfikowany jako męczennik Kościoła katolickiego.